一、minicanda 的安装
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创建安装目录cd ~/biosoft -
下载安装脚本
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -
使配置文件生效
source ~/.bashrc -
命令行输入
conda -v看到有版本号输出说明成功了conda -V
二、minicanda 的软件安装与卸载
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已安装软件目录
conda list -
查找软件
conda search fastqc -
软件安装
conda install fastqc -y # 默认最新版本 conda install fastqc=0.11.7 -y # 指定版本 -
卸载软件
conda remove fastqc -y
三、minicanda 的环境配置
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查看当前conda环境
conda info --envs -
创建新的conda环境
conda create -n rna-seq python=3 -y # 创建rna-seq的conda环境，python版本指定为3 -y:say yes in every step conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y # 创建环境的同时安装软件fastqc，trimmomatic -
激活新的conda环境
conda activate rna-seq -
退出当前conda环境
conda deacivate
四、Typora工具
- 一个很好用的工具，可以用来打草稿，推荐Github格式，之后源码模式粘贴到简书，markdown格式保留。
