SRA工具包文档

SRA工具包文档
SRA工具包安装和配置指南
受保护的数据使用指南
常用工具：
fastq-dump：将SRA数据转换为fastq格式
prefetch：允许命令行下载SRA，dbGaP和ADSP数据
sam-dump：将SRA数据转换为sam格式
sra-pileup：将比对好的SRA数据生成堆积统计信息
vdb-config：显示和修改VDB配置信息
vdb-decrypt：解密非SRA dbGaP数据（“表型数据”）
其他工具：
abi-dump：将SRA数据转换为ABI格式（csfasta / qual）
illumina-dump：将SRA数据转换为Illumina本机格式（qseq等）
sff-dump：将SRA数据转换为sff格式
sra-stat：生成有关SRA数据的统计信息（质量分布等）
vdb-dump：输出SRA数据的本地VDB格式。
vdb-encrypt：加密非SRA dbGaP数据（“表型数据”）
vdb-validate：验证下载SRA数据的完整性

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