【r<-芯片处理】入门GEO表达芯片数据分析该读一读的一些文章

刚参加完生信技能树TCGA挖掘培训回来，里面内容有不少涉及GEO数据分析方面。下面整理一些非常值得一读都一些文章，帮助初学者掌握一些基本概念，基本流程。一旦你理解并学会使用R了，那么进行自定义地分析就不难了。

Bioconductor分析基因芯片数据
如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析

基因芯片（Affymetrix）分析1：芯片质量分析
基因芯片（Affymetrix）分析2：芯片数据预处理
基因芯片（Affymetrix）分析3：获取差异表达基因
基因芯片（Affymetrix）分析4：GO和KEGG分析
基因芯片（Affymetrix）分析5：聚类分析
使用oligo软件包处理芯片数据

最后给一个模拟差异分析的示例 https://github.com/ShixiangWang/MessageBoard/issues/13

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