血清素又称5—羟色胺，它的存在对人体的很多生理功能有影响，如：饮食、睡眠、情绪、体温、性欲等。如果血清素不足，容易发生抑郁、愤怒、情绪冲动。如果有莫名的情绪低落，也许就是血清素含量低引起的。血清素水平低还会使得人体海马体、前额叶皮质、前皮质扣带回等脑区活动减弱，导致记忆减退，思维迟缓，对任何事都不感兴趣。杏仁核活动加强，使得负面情绪增加。缰核区域活动增加，通过释放氨基酸到中脑区域，影响多巴胺分泌，奖赏系统也受到抑制，所以情绪会更加低落。研究表明，女性合成血清素的速率仅为男性的一半，某种程度上可以解释为什么女性情绪更容易波动，以及更容易焦虑和抑郁。血清素水平高低取决于色氨酸水平、维生素B6、维生素D的水平。长期的压力和劳累会导致体内血清素水平减少。以上对血清素的医学研究也从侧面说明了抑郁症的成因。
咨询师面对抑郁症来访者时，首先要询问是否接受过精神科医师的诊断，抑郁的严重程度如何，达到中重度以上的来访者是否遵医嘱服药，来访者有无自杀自伤的意图，必要时要做危机干预处理。将这些流程过一遍，留下符合心理咨询条件的来访者。一般来说轻症的，或者是已经吃药见效情绪稳定的中度以上患者，是可以进行辅助的心理咨询的。
对于这些来访者，咨询师一方面邀请他们讲出自己的人生故事，一起探索这些经历带给来访者的情绪感受。咨询师要通过心灵的外置和重构技术，带领来访者“看见”三境三时中的自己，看见就是疗愈的开始；另一方面，可以利用一些辅助的方法提高来访者体内的血清素水平，如体育锻炼、晒太阳、合理饮食、正念练习等。这样双管齐下，应该对来访者的抑郁情绪有很大的缓解。
