KEGG Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 京都基因与基因组百科全书
特点：
- 综合数据库，建立了跨物种联系。
- 基于可计算的形式捕捉和实验证据，形成生物系统的计算机模拟。
- 信号通路和分子间关系可视化。
用途：
- 16个子数据库，最常用Pathway（下图）
-
与其他数据库链接如ENSEMBL等。
KEGG Databases.jpg
初探示例：
- Disease数据库检索glioma。信息检索的精髓是关键词搜索和蓝色超链接。
- 检索基因pten，需输入物种标识符，检索框中输入hsa:pten
KEGG Pathway
- map：原始手工图
- ko：链接至带有ko编号的基因
- ec：链接至酶
- rn：链接至反应
-
org：物种特异通路图，没有填充绿色的框说明该物种中无此基因。
图片.png
KEGG Mapper
如果需要查看多个基因共同参与的信号通路，就要应用KEGG Mapper。例如通过芯片、测序、IP-质谱等获得了参与调控的一组分子，希望分析它们参与的信号通路网络。
步骤：
KEGG首页，Analysis tools - KEGG Mapper --> Search & Color Pathway --> 填写参数
更多精彩详见PDF《KEGG信号通路数据库使用》
