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图片来自pad os端mindnode

Linux环境下软件安装

1.认识conda

Linux系统下的软件包管理器，类比于iPhone的app store

2.在服务器下载miniconda

到达生信软件目录下:cd biosoft
下载软件:wget *清华镜像网站复制的链接*

3.安装配置miniconda

3-1安装：bash M+tab键
3-2激活conda:source ~/.bashrc
3-3添加镜像: copy code and press enter

4.使用miniconda

4-1查看所有软件列表:conda list
4-2搜索软件:conda search software
4-3安装软件

• 自动安装:conda install software -y
• 指定版本:conda install software=6.6.2 -

4-4卸载软件:conda remove software -y

5.定制conda环境

5-1 查看当前环境:conda info --envs
5-2创建指定python版本并安装软件的conda环境
conda create -n rnaseq python=3 fastqc trimmomatic -y
5-3激活新的环境:conda activate rnaseq

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