今天是跟着生信星球的第6天,今天的主题是R包
R包的安装和加载,
关于R包的下载涉及的镜像问题,一般来说,RStudio直接install,Biocmanager可以去R源那里下载,也可以配置文件.Rprofile,更改镜像源来下载。
install.packages()#安装,因为生信主要是Biocmanager,所以需要更改镜像
library(Biocmanager)
Biocmanager::install()
library()#加载
R包举例:dplyr
dplyr包的核心函数有5个:arrange();filter();mutate();select();summarise()。
1.arrange()
默认按照升序排序;arrange(Data,desc())按照降序排序
2.filter()
筛选
3.mutate()
新增列
4.select()
按照列选择,还可以使用一些辅助函数如start_with()等,也可以更改列名(一般不用,改名一般用rename()函数)
5.summarise()
汇总
小技巧
1.管道操作符
如%in%;%>%等
2.count统计某列的元素值
关系处理
join函数(类似基础包的cbind()函数和rbind()函数,列、行)
full_join()
semi_join()
left_join()
inner_jion()
anti_join()等
总结

第6天总结.png