day3学习笔记
先供上思维导图,比较详细
然后是文字版的笔记
conda相当于linux 的应用商店,只是没有图,只有名字
1.打开linux,确认服务器的版本型号,uname -a,
2.百度“miniconda 清华”,找到对应的服务器的最新版,复制url
3.代码:wget 网址url(然后linux会自动下载)
4.代码:ls后可看到你下载的sh脚本,然后bash加名字开始安装,enter键阅读license等东西,最后按照提示输入yes
5.安装完成后要激活conda , 代码:source ~/.bashrc
6.添加conda镜像,加快下载速度
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
至此安装结束
怎么使用呢?
linux没有图形,所以我们必须手动写入链接(就像windows系统每个图片背后都有链接一样)
常用的几个操作
1.打开商店界面:conda list
2.搜索软件 conda search 软件
3.安装软件 conda install fastqc -y (-y是下载后自动安装,建议这个省事)
4.输入软件名字检查能不能用
5卸载软件conda remove 软件 -y(已定价-y,这个装了了一步到位)
若有不明白的指令,可以conda create --help,查看指令意思
大致如上,思维导图里还有切换操作环境的介绍,由于网速问题我的操作一直没成功,就不在这记录了。