NCBI上BLAST的手册中对makeprofiledb的介绍：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279684/
在做rpsblast时，可以对自建的蛋白结构域数据库做比对。如：要对PKS/NRPS蛋白结构域做BLAST，如何自建一个PKS/NRPS蛋白结构域数据库？
一、流程
S1：挑出PKS/NRPS蛋白结构域的smp文件。
S2：放到一个文件夹里。
S3：写一个PKS.pn文件，里面是S1所挑的smp文件的名字，一名一行。PKS.pn同样放在这个文件夹里。
S4：参考NCBI上BLAST的手册中对makeprofiledb的介绍在该文件夹里输入
makeprofiledb -title PKS.v.1.0 -in PKS.pn -out PKS -threshold 9.82 -scale 100.0 -dbtype rps -index true
则建好了一个名为PKS的数据库
S5：输入以下命令行，则是用这个自建的PKS数据库，对20genome.fasta运行rpstblastn
rpstblastn -query 20genome.fasta -db ./domains/PKS -out op.out -evalue 0.00001 -outfmt 6
二、makeprofiledb的参数介绍
参考NCBI的BLAST手册
三、其他makeprofiledb命令示例
