变量的最后一个主角，便是通路。通路一般作为因变量或下游效应变量出现，是一群有顺序地传递信号，发挥协同或相似功能的明星分子的集合。是实验论证中，往往也只需要检测几个代表性的biomarker通路蛋白和磷酸化蛋白的表达量，来表示通路受到影响。

以下9路神仙可独当一面，也可crosstalk，这样参与科研故事的三个大戏就已悉数登场。分子，药物，通路，三变量+五恒量。单个舞台的逻辑框架和层次已经达成，在实验设计中，懂得靠明星通路，解释主变量部分HOW的问题，可以跨越3分文章的水平。

通路如何筛猜，在13#阴阳两仪中也有说明，我把他也放到这里来。

筛通路：1.抗体库，每个通路选1-2关键分子（如Wnt选b-Catenin；PI3K/AKT选磷酸化的AKT；JAK-STAT选磷酸化的STAT3），发现活性有改变，再检查上下游明星蛋白，有的放矢，但文章中仍要聚焦一条。2.通路芯片，pathway array，包含成百上千个位点抗体，通量高，+WB验证。3.用通路的抑制剂和激活剂。

第6策通路圆满，第一章众妙之门便已收官，这一章讲述了基础科研恒量变量勾搭形成舞台故事的逻辑和框架。至于怎么谁来唱戏，怎么唱的更好，我们且看第二章。

知识积累：

信号作用于细胞的5种结局：促进代谢、细胞分裂、细胞分化、细胞死亡或其他-激活某种特定细胞功能。

狭义的信号通路：细胞外分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的酶促反应通路。

信号通路三信使：第一信使：胞外配体。第二信使：胞内信号分子。第三信使：转录因子。

信号通路的三个基本构成元件：1.配体（细胞外的分子信号）和受体（细胞膜或细胞内，可与配体结合）。2.蛋白激酶，上游蛋白通过磷酸化作用于下游蛋白，使下游蛋白构象改变。3.转录因子，通路的效应器。

明星通路：

1.(TNF-a和TNF-b→IKK→) NF-KB（促进转录→CyclinD1和c-Myc等），该通路持续激活会导致生长失控，抑制细胞凋亡，促进肿瘤转移和血管新生等，比较万金油;

2.（EFGR→）PI3K/AKT(→凋亡相关蛋白Bad，Caspase9)，调节增殖、分化、凋亡及迁移等表型。或PI3K/AKT/mTOR（→HIF1a，c-Myc，FoxO）。（PI3K与PTEN作用相反）

3.（细胞因子，神经递质，激素→）MAPK→MKK→MKKK→（分支通路还有ERK,JNK,p38MAPK,ERK5等），该通路调节细胞的生长、分化、应激和炎症反应等。

4.（白介2、GM-CSF、GH、EGF、PDGF、IFN）→JAK-STAT（→调控下游靶基因），该通路与增殖、分化、凋亡有关系，也是个万金油。

5.（TGF-b、BMP→）TFG-b/SMAD，与EMT调节相关。

6.（跨膜受体FZD→）Wnt（→b-Catenin→TCF/LEF→启动下游靶基因转录），与EMT调节相关。

7.Notch（→蛋白酶水解→NICD\ICN→结合CSL→调节靶基因表达），Notch通路的受体配体都是膜蛋白，是细胞相互靠近接触后的活化状态。

8.Hh蛋白→Hedgehog→（Smo正向激活 or Ptc抑制Smo的活性）→Gli蛋白家族。与Wnt、Nocth常cross talk。

9.膜蛋白受体→Hippo→YAP/TAZ。调节细胞的增殖、分化以及凋亡。与Notch、Wnt、MAPK都有交集。