有很多现成的软件可以做，我使用的是gtf2bed
用法：在使用gtf2bed的时候，会出现推荐使用convert2bed 命令，具体用法如下：

convert2bed -i fileformat < filename.gff3 >filename.bed （需要保留< > 符号）

真实命令：

convert2bed -i gff < IWGSC_v1.1_HC_20170706.sorted.gff3 > IWGSC_v1.1_HC_20170706_part_gff2bed.sorted.bed 

最后生成的bed如下：

chr1A   40097   40731   TraesCS1A02G000100.1.exon1      .       -       IWGSC_201706    exon    .       ID=TraesCS1A02G000100.1.exon1;Parent=TraesCS1A02G000100.1