1.向量和标量

1.1概念

标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
一个向量是一排有序排列的元素，以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

1.2向量中提取元素

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

2.数据框

2.1读取本地数据

x<-read.csv('doudou.txt')
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header = T)

sep参数：分隔符，默认为空格。可以设置为逗号(comma)sep=','，分号(semicolon)sep=';'和制表符(tab)。header参数：默认为FALSE即数据框的列名为V1,V2...,设置为TRUE时第一行作为列名。

2.2设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

read.csv函数header参数默认为TRUE，不同于read.table。

2.3数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

2.4变量的保存与重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

2.5提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

2.6直接使用数据框中的变量

散点图

options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)

散点图

作业：
save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found
这个可能是前面没有对X下过定义，要注意X的大小写！
我一开始也是这样的

找不到对象X

学习小组Day5笔记--高晨Xmind

以上代码均参考
生信星球培训

学习小组Day5笔记--高晨