02 barplot 免疫浸润

#读取免疫文件整理数据

immune=read.table("CIBERSORT-Results.txt",sep="\t",header=T,row.names=1,check.names=F)
immune=immune[immune[,"P-value"]<0.05,]
immune=as.matrix(immune[,1:(ncol(immune)-3)])
data=t(immune)
col=rainbow(nrow(data),s=0.7,v=0.7)#颜色彩虹色
#画图
par(las=1,mar=c(8,5,4,16),mgp=c(3,0.1,0),cex.axis=1.5)
a1 = barplot(data,col=col,yaxt="n",ylab="Relative Percent",xaxt="n",cex.lab=1.8)
a2=axis(2,tick=F,labels=F)
axis(2,a2,paste0(a2*100,"%"))
axis(1,a1,labels=F)
par(srt=60,xpd=T);text(a1,-0.02,colnames(data),adj=1,cex=0.6);par(srt=0)
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#export it need larger width
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