生信星球学习小组第80期 Day3 — 路小悠

linux环境下软件安装的准备工作

认识并下载miniconda

wget命令

miniconda的安装

安装 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
激活 source ~/.bashrc

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添加镜像

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conda入门

  • 查看当前服务器上安装的所有软件 conda list

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  • 搜索conda软件 conda search fastqc

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  • 安装软件 conda install fastqc -y

  • 卸载软件 conda remove fastqc -y

构建conda环境

  • 查看环境 conda info --envs

  • 构建新环境,同时安装软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

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  • 激活新环境 conda activate rna-seq

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    base变rna-seq

  • 退出当前环境 conda deactivate

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