《利用条件随机场实现中文病历文本中时间关系的自动提取》——阅读笔记


摘要

提出一种基于CRF的时间关系提取算法。以经过医学问题和时间信息语义标注的病历为训练内容,时间关系结果标注采用以医学问题为中心的模式。以63份实际病历作为实验文本。

引言

时间关系非常重要,如,哥伦比亚大学Zhou等开发的TimeText系统。中文面向医学临床文本,服务于医疗信息化的研究仍处空白。

1 条件随机场

CRF 避免了隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMM)的独立性假设,解决了最大熵模型(MaximumEntropy,ME)所带来的标记偏见问题,不像ME 在每一节点都要进行归一化,而是对所有特征进行全局归一化,可以求得全局的最优值,因此在自然语言处理领域的众多序列化标注任务中得到广泛应用。

1. Zhao Hai,Huang Changning,Li Mu. An improved Chinese word segmentation system with conditional random field[A]. In: Dale R,eds. Proceedings of the Fifth SIGHAN Workshop on Chinese Language Processing [C ]. Sydney: 2006 Association for Computational Linguistics,2006. 162 - 165.

2. Peng Fuchun,McCallum A. Information extraction from research papers using conditional random fields[J]. Information Processing & Management,2006,42(4): 963 - 979.

2 中文病历文本中的时间关系提取

定义医学问题时间属性标签。

处理流程:首先利用各种医学语言处理技术实现对于病历文本中医学问题和时间信息的自动语义标注,然后以医学问题为中心的模式对其进行手工时间关系标注,形成CRF训练预料,最后根据训练预料中时间与问题之间的规律,设计CRF学习模板,使用学习模板通过训练获得CRF模型,基于生成的CRF模型可以实现对时间关系的自动提取。

2.1 语义标注

对于医学问题的予以标注依赖于简历的一个具有语义注释的医学术语库(包含医学问题和描述问题变化的词语),采用反向最大匹配法来实现。采用正则表达式匹配~

2.2 语料准备

采用crf++。

手工按照[表1]所示类型为训练数据标注正确的时间关系,最终形成的训练语料第一列数据是原始文本分解后的token,第二列是相应的予以标注,第三列是用于crf++学习的时间关系标注正确结果。总共63个病历文本,319个病历语句。

2.3 模板准备

基于对样本标注模式的窗口跨度等的统计,一维原子模板选取距当前标记距离为4的上下文标记,多维复合模板为原子模板的组合。高维特征能把握更多的长距离依赖关系,但也需要更大的训练开销,并带来更严重的数据稀疏问题,本文最高维设定为4维。

3 实验以及结果的讨论

有一定的应用潜力,准确率在80%以上。

某个特定模板是否引起过拟合现象不仅在于训练预料的特点,亦和模板文件中个模板之间的关系相关。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 203,547评论 6 477
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,399评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 150,428评论 0 337
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,599评论 1 274
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,612评论 5 365
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,577评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,941评论 3 395
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,603评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,852评论 1 297
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,605评论 2 321
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,693评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,375评论 4 318
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,955评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,936评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,172评论 1 259
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 43,970评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,414评论 2 342

推荐阅读更多精彩内容