初识markdown
优雅简洁的文本记录体验
之前就有关注简述生信的帖子,进去之后,首先给我的印象就是帖子的格式,我自己也会记一些笔记,模仿分级记录、加粗、插入图片等方式,但只是在word 上去自己生硬的‘造’出类似的格式,很丑。今天进入生信星球的学习课程,第一次了解到markdown这样的文本记录方式,完美契合我想要的记录笔记的感觉!谢谢花花!
一些简单的练习
直接进入网站链接吧,以我最近在学习的GEO数据分析为例,首先感谢。
GEO再学习-GSE42872
文中详细的介绍了如何去下载GSE数据集,以及如何去下载实验平台数据,同时告诉我多数实验平台可以找到对应的R包,但其实我自也有试过一些没有对应包的实验平台,走到一半就不行了。其实在进行探针名和基因名匹配时候,有一下几点问题:
- 探针和基因转换后,许多,应该如何去掉
- 对于将探针名和基因名匹配后得到的 ,有些人需要对其进行排序,这个地方也是疑问,为什么需要排序,如何去排序?
- 进行匹配和,如何将探针名对应到基因表达矩阵中,这是我最大的困惑
当然除了这个探针基因名转换外,还有对于数据的,这个也很重要呀。
就先列举这两个问题吧,当然还有许多疑问,但是
饭要一口一口吃,路要一步一步走
希望和豆豆、花花可以学习到解决问题的办法。
放一段代码吧,我的师兄说这个管道符号用的好,我还一脸懵逼,管道?
mutate(genename=rownames(DEG)) %>%
dplyr::arrange(desc(logFC)) %>%
.$genename %>% .[1:50]
加油学习吧?!!
配一张图,作为结束。