生信分析 公共数据库 SRR 数据下载

第一种,在EBI 查找,
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home 常规转录组可能直接找到下载R1,R2

网站信息,复制R1R2的链接即可下载

第二种,从NCBI的ftp服务器直接下载,

ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/srr/ 如果下载SRR数据,可以在这里获取直接连接,根据SRR号的前三位,后三位/后两位定位数据。速度还行,多线程速度感人。

对应项目的SRR号

FTP 服务器信息
根据SRR号前三位,后三位/两位数值查找
复制对应文件地址
下载文件可能需要改名为SRA拆分
多线程下载速度感人

第三种,从对应样本的目录下直接下载

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