tximport报错:Error in .local(object, ...) : None of the transcripts in the quantification files ...

salmon数据用txiport导入R时,明明用的都是一样的转录本注释,但是提示None of the transcripts in the quantification files are present

txi <- tximport(files, type = "salmon", tx2gene = t2s)
#reading in files with read_tsv
#1 2 3 
#Error in .local(object, ...) : 
 # None of the transcripts in the quantification files are present
  #in the first column of tx2gene. Check to see that you are using
  #the same annotation for both

根据提示修改,添加参数后解决了问题:


image.png
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容