《莲花楼》讲述了十年前，四顾门门主李相夷以卓越的相夷太剑技艺成为武林正道的典范，然而他与金鸳盟盟主笛飞声在东海进行了一场决战，两人因此消失在万顷碧波之中。四顾门与金鸳盟也在这次决战中两败俱伤，逐渐消失在江湖中。
十年后，一位名叫李莲花的乡间游医带着一座莲花楼四处行医，无意间得到了名医的头衔。尽管他并不想涉足江湖，但无奈之下被卷入了江湖恩怨。
热血少爷方多病梦想着行侠仗义，安顿天下。他发现李莲花假冒名医的罪证，于是发誓要揭穿他的真面目。而将李相夷视为竞争对手的笛飞声，在重返江湖后认出了不起眼的游医李莲花就是李相夷，自然不会轻易放过他。
经过一系列案件的调查，三人竟然在嬉笑怒骂的破案过程中结下了深厚的友谊。原本已无心江湖之事的李莲花和笛飞声在方多病的激励下，重新燃起了热血豪情。此时，当年的事情也一一被揭开，原来是当年单孤刀诈死引发四顾门和金鸳盟陨落的真相，并透露了他创建万圣道崛起的事实。然而，他强调称霸武林并不是他的最终目的。他坦言自己是芳玑王与萱妃的后代，流淌着南胤皇族与当朝皇族的血液。他透露，百年前宗亲王篡位谋权，现在他只是想要拿回原本属于他的一切。
在众人的成功努力下，单孤刀篡位的阴谋被阻止了。令人震惊的是，李莲花才是真正的龙族血脉，是芳玑王和萱妃之子。在解决了单孤刀之后，笛飞声回到了四顾门，他对李莲花的决斗也逐渐放下。李莲花毁掉了少师剑，选择了归隐，而方多病带着狐狸寻找了李莲花许久。
