关于文献阅读,我是这么做的

自从入了科研的坑,阅读文献就成了一个必须掌握的技能。通过阅读文献可以建立自己的科研思维,这是导师一直要求的,而自己后知后觉,不久前才意识到这一点。但通过阅读文献可以让自己更好地做科研,这个应该是公认的,因为当你有目的地去做一件事的时候,对结果的期待可能会让你忽略过程中的艰辛。

关于阅读文献,每个人都有自己的做法,之前也与周围的人交流过,大家习惯都不太相同。但自己还是想将自己的方法分享出来,看看有多少人也在这样看文献。之前方法纠结的太多,文献却看了没多少,以后再慢慢赶上来。

文献阅读无非是为了了解自己关心的研究领域的过去现在将来Pubmed上的文献浩瀚如海,如何快速找到合适的文献,也是一个很重要的技能。这块自己了解的不多,就不赘述,这次只是介绍下自己对于文献阅读方法的理解。

在我的观点里,一篇文献可以有至少三种存在的形式

  1. 作为参考文献的形式而存在
  2. 作为记录和可阅读的pdf形式而存在
  3. 作为被阅读者理解的word形式而存在

对于参考文献的管理

这方面最著名的软件就是大家耳熟能详的endnote,还有国产的Noteexpress,这个我首推Noteexpress。该软件对中文支持较好,当我无意间发现显示文献的表头可以自定义的时候,仿佛发现了一片新天地。


根据影响因子排列,可以快速找到比较经典的文章,通过标签添加一些个性化的字句,提醒自己这篇文献的特点。Noteexpress官网是http://www.inoteexpress.com/aegean/index.php/home/ne/index.html,有兴趣的可以试一试。新版对参考文献的显示类型有一些限制,可能需要付费解锁。

对于文献pdf文件的管理

最早就是文件夹+PDF阅读器的形式用于科研文献的管理,虽然下载的文献可能有各种特定的名称,但一般还需要我们重新命名,有点麻烦。有时候查找也会很辛苦,当然可以搭配everything来快速检索,前提是你要有个规范的文件名称。
Endnote和Noteexpress也提供以附件的方式将pdf和引文关联到一起,这个方法也不错,只是自己被一些新的软件所吸引,就没有去尝试这种方法。
最早是接触到ReadCube这款软件,界面简洁清新,pdf一拖就能自动识别各种信息,双击后就能看到文献内容,不用再改名字,感觉特别高大上。但由于服务器在国外,时不时就登不上去,同步也有限制,需要美刀提高软件体验,后来就放弃了,转投Mendeley的怀抱。
Mendeley的界面感觉不如readcube,但好在免费,同步也很给力,慢慢用起来也习惯了,主要用它配合Noteexpress使用,直接通过检索功能快速找到文献,潜心阅读感觉也不错。


关于这块就看大家的习惯,反正能真正读进去才是最重要的。

关于阅读文献后的记录

这块我一直没找到合适的软件。用word记录虽然没有问题,还可以插入文献,读得多了,慢慢就能凑出一篇review了。但我总觉得,把每篇文献的阅读体验按照模块存到数据库中,也许是更好的一种方式,回过头来看自己曾经读过的那些文献的体会,也许又能提炼出一些新的思路和想法。

文献追新,你是怎么做的?

做科研不能只是埋头做,也要看看周围的课题组或其他国家的人,现在都做出了哪些工作。文献追新,我是这么称呼的,就变得很重要。不要别人已经发明了轮子,自己却还在苦心钻研,这样浪费的,只是自己的时间和课题组的心血。
现在文献追新的app有很多,我以前曾关注过pubmed上的rss推送,后来接触到Read by QxMD,就一直使用它。虽然我自己没能坚持时刻关注着它,但它还是坚持着提醒我,关心的领域又发了哪些文章了。用好它,能让你的科研工作顺利不少。Read by QxMD的官网是https://www.readbyqxmd.com/,我比较喜欢它的My Followed Keywords,利用pubmed中的MeSH主题词查到感兴趣的专业词汇,再利用Read by QxMD追踪,是我现在喜欢的形式。


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关于文献阅读,不知道大家都有什么好的方式,欢迎交流。

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