linux环境下的软件安装
软件管理器 conda系列
linux系统中方便快捷的下载器 -- conda ，相当于我们的软件商店，大致常见的软件包管理器有下面这些：
conda：大boss，一个大的涵盖许多领域的软件包管理器；
miniconda : 区域经理，业务范围：conda + python + base packages
anaconda : 总管，职务比conda低，业务范围：miniconda + 150 high quality packages
其中，miniconda主要负责生信领域，也是官方推荐最easy的方式
操作
- 创建biosoft目录
mkdir biosoft
- 下载miniconda
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 激活conda
source ~/.bashrc
- 添加镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
注：一次性全部复制，一起回车
- 查看软件列表
conda list
- 搜索软件
conda search fastqc
- 安装软件
conda install fastqc -y
