BITE 包的安装:BITE: BioInformatics Tools for Everyone
Github地址:GitHub - marcomilanesi/BITE: BITE: BioInformatics tools for everyone
R版本不能高于v 4.2,本次安装使用R版本为R v4.1.0,rtools安装见Rtools的安装与配置 - 简书 (jianshu.com)
1.安装依赖包
GenABEL 的依赖包:devtools::install_url("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/GenABEL.data/GenABEL.data_1.0.0.tar.gz")
GenABEL (>= 1.8-0) :devtools::install_url("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/GenABEL/GenABEL_1.8-0.tar.gz")
RCircos (== 1.1.3) : install.packages("RCircos")
reshape2 (>= 1.4) : install.packages("reshape2")
RColorBrewer (>= 1.1) : BiocManager::install("RColorBrewer")
car (>= 2.1-2) : install.packages("car")
rmarkdown (>= 1.6) : install.packages("rmarkdown")
knitr (>= 1.17) : BiocManager::install("knitr")
kableExtra (>= 0.6.1) : install.packages("kableExtra")
beanplot (>= 1.2) : install.packages("beanplot")
2.安装BITE
在GitHub - marcomilanesi/BITE: BITE: BioInformatics tools for everyone下载BITE安装包,打开Rstudio,选择Install,找到下载好的BITE包的位置进行安装即可。
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