生信SCI2-3分怎么发,非肿瘤类生信发文套路
文章一:Gene expression profiling predicts pathways and genes associated with Parkinson’s disease
2015年从GEO下载一套PD数据,进行差异基因分析与验证,再通过通路以及GO分析与PPI网络构建进行书写。讨论部分可以借鉴作者的写法(经典的总分总),揭示PD诊疗可能存在的靶基因与通路。
文章2 ScRNA seq analysis reveals mitochondrial dynamics in oocytes of patients with polycystic ovary syndrome
三分生信套路2020.3月底,可以重点借鉴。(单细胞转录组测序+WGCNA)做纯生信分析,发现多能卵巢综合征的线粒体新功能。
借鉴点:
1文章示意图以及流程图的摆放非常漂亮可以借鉴
[if !supportLists]2. [endif]Introduction写法第一段:(先介绍流行病学+临床表现),but机制上存在未知。(目前疗法+but治疗缺陷)第二段:研究对象B作用是什么,与表型有什么相关作用,机制上目前未知...。第三段:在本文中,作者分析了什么数据,通过结合什么,作者确定了PCOS线粒体动力学与线粒体功能与卵巢细胞的功能相关。
[if !supportLists]3. [endif]文章摆图借鉴:Fig1:流程图示意 Table1:临床数据为方便WGCNA关联,关联方式可以与外在性状关联,也可与疾病发展阶段关联。与疾病形状关联可能会存在p值较大不好显示差异的情况。 Fig2通过Metasscape对不同模块进行聚集分析,再利用GSEA分析发现氧化磷酸化通路显著,于是将通路富集到线粒体上。 Fig3 上述完成不同时期WGCNA分析之后,作者又对每个时期正常女性与多能卵巢女性差异进行分析(按照疾病的三个阶段,进行差异分析,通过Veen图找出共有以及独特的差异)Fig4:对于生物过程,作者对得出的差异进行富集分析(整体分析套路都是找到差异模块,再进行富集分析)。Fig5:找到显著差异的9个与线粒体相关基因,展示其不同状况阶段的表达量 Fig6:在KEGG上画一个很秀的图值得借鉴。