细菌感染： 排除掉带“病毒”的名字
合并细菌和不合并细菌感染的VTE和PE的发生率 PE_yingxiang HVTE的发生率
合并细菌感染的人群的菌类分布——菌谱
不同菌类感染 的VTE和PE的发生率
一个患者共感染的细菌数量，不同数量的VTE和PE的发生率
感染途径是医院获得和社区获得，感染时间-入院时间<48小时
霉菌和细菌的分类（待做）
混杂因素分析（待做）
多重耐药菌（待做）
敏感、耐药的分布待讨论
0 细菌感染： 排除掉带“病毒”的名字
table(bi_vte$bacterial_infection)
0 1
3096 1342
感染率：0.3023885
1 合并细菌和不合并细菌感染的VTE、PE的发生率
合并细菌和不合并细菌感染的VTE的发生率
table(bi_vte
HVTE)
0 1
0 2970 95
1 1222 99
合并细菌VTE 0.07494322
不合并细菌感染的VTE 0.03099511
合并细菌和不合并细菌感染的PE的发生率
table(bi_vtePE_yingxiang)
0 1
0 3038 27
1 1303 18
合并细菌PE 0.01362604
不合并细菌感染的PE 0.008809135
2 合并细菌感染的人群的菌类分布——菌谱
bi_freq.csv
bi_freq_new.csv
3 不同菌类感染 的VTE和PE的发生率
白念珠菌
bnz <-bi_vte[grepl("白念珠菌",bi_vteHVTE)
0 1
586 46
0.07278481
铜绿假单胞菌 234
0.1077586
鲍曼不动杆菌 199
0.1060606
烟曲霉 162
0.08024691
肺炎克雷伯菌 157
0.0516129
光滑念珠菌 130
0.1129032
热带念珠菌 99
0.05050505
纹带棒杆菌 96
0.07291667
念珠菌属 78
0.07692308
黄曲霉 77
0.1060606
4 一个患者共感染的细菌数量 ，不同数量的VTE和PE的发生
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
0 3096 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 0 711 321 163 73 46 18 7 2 1
bi_count_VTE
bi_count_PE
5 感染途径是医院获得 H_BI 和社区获得 C_BI，感染时间-入院时间<48小时
table(bi_VTE_newHVTE)
0 1
2764 90
C_BI 1186 74
H_BI 242 30
table(bi_VTE_newPE_yingxiang)
0 1
2828 26
C_BI 1245 15
H_BI 268 4
