我在使用GOplot包的函数chord_dat时发生了报错

我在跑chord <- chord_dat(circ, genelist, go$Term)命令时，报错如下：

Error in `[<-`(`*tmp*`, g, p, value = ifelse(M[g] %in% sub2$genes, 1, :

  subscript out of bounds

我去检查了go和genelist的数据结构发现，genelist里的gene用的是gene名，而go里的基因用的是基因ID，不一样了，所以跑不出结果，所以我把genelist的gene换成了基因ID，就能跑出来了。

我发现在运行kk计算的时候，会随机在基因名和基因ID之间跳转，有时候会生成geneID，有时候又是基因名，所以要根据go生成的数据里生成的是基因名还是基因ID，来调整genelist的gene的形式的选择。