张居正的不在人间，使得整个帝国失去重心，接任的申时行的安抚并没有为帝国带来希望，随着时间的推移，政事每况愈下，但是并无恢复正常的迹象。
这次是万历也以皇帝的身份消极怠工，事出有因，一者为文官集团不允许废长立幼，再者为自己，对于臣僚的意见，既不强迫接受，也不反对，典型的消极怠工。由于万历的放弃职责，使得文官集团和皇帝之间的矛盾越来越来，却又奈何不了对方。
随着万历的去世，使得文官集团的内部矛盾日益增加，1591年申时行被迫去职时，舆论对他也丧失了同情，对于皇位继承人这点上，使得申时行，二辅许国相继离职，可见文官集团的可怕，在立储问题上，万历犯了一个最致命的错误，就是低估了四书中关于伦理的力量，皇帝和全国臣民都懂得父亲对儿子不能偏爱，哥哥对弟弟负有教导及爱护的义务，男人不能因为宠爱女人而改变长幼之序。正是因为这些原则为天下人所认同，才有一套共同的理念。又是如何造成万历，一定要对立储这件事上，显示自己的权威呢？
这个就和万历所处的朝堂环境有关了，他的祖先，一言一行都被臣下恭维成道德标兵，而他，确实在大臣的教育下长大的，如果说，万历的坚持，也可以说是长久以来，而他一直被日益成熟的文官集团压制，他的这个皇位，实际上不是leader，而仅仅是一个权威的象征，一切都要看文官集团的脸色，名义上贵为天子，实际上权利是受制于臣。
从张居正张先生出任首辅的时候，开国时的理想和所倡导的风气，与今天相去甚远。其中造成这个问题的根源，便来源于财政的安排，初期，政府制定各种制度，依据取自四书，认为官员应该朴素。久而久之，精神和物质的冲突，越发明显，逐渐走向两极化。下面我们从两代首辅的政策来看一下。
张居正：提出一套改革方案，在位时，文官压力颇大，招致了死后的清算和文官集团的集体爆发。
申时行：提出一套中和方案，对文官并无很大作用。
从万历的无为看来，更像是一种报复行为，可能是随着文官集团对于他限制日益加深，也可能是皇权受到了极大的挑战。。
