使用deeptools computeMatrix分析ChIP-seq数据,
前期数据整理时,使用R整理和导出bed文件;反复运行报错;
折腾大半天,终于发现原因,写出bed文件时,write.table必须限制quote = F
write.table(Whyte_TypicalEnhancers_ESC_3,"Whyte_TypicalEnhancers_ESC_3.bed",sep="\t",col.names = F,row.names = F,quote = F)
使用deeptools computeMatrix分析ChIP-seq数据,
前期数据整理时,使用R整理和导出bed文件;反复运行报错;
折腾大半天,终于发现原因,写出bed文件时,write.table必须限制quote = F
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