这本书讲述了一个智商只有68的智障成年男子，自愿通过科学实验变成天才的心理变化历程以及期间所体会到的人生百味。
纯真善良但先天弱智的查理·高登知道自己由于不聪明而不受父母喜爱。以为只要自己变聪明就可以赢得他人喜爱的他，像抓住一根救命稻草一样，接受成为一场科学实验手术的第一位人类。在这之前，实验白鼠阿尔吉侬已经通过手术变成了智力超群的老鼠，手术后的查理也慢慢像阿尔吉侬一样一跃称为天才。变成天才后的查理虽然获得了巨大的知识并且赶超了周围原先他以为是知识权威的人物，但也渐渐发现原先他以为善良美好的世界原来是如此丑陋不堪，他一直以为是朋友的人原来只是在捉弄以前身为智障的他，他拥有了知识，知识却也在他和他所爱的人之间筑起了一道高墙......在查理攀登上智力的高峰之后，他也了解到这项实验终究难逃失败的命运。他亲眼目睹了阿尔吉侬智力慢慢下降并最终衰竭致死，知道自己也终将变回成智障，他能够做的只是在阿尔吉侬的坟墓前献上一束花束。
在查理拥有只会之后，他不可避免的陷入了经典的哲学疑问：“我是谁？我从哪里来？我要到哪里去？这样的人生究竟有什么意义？”我是谁？这个问题我也曾经问过我自己，我也会想，为什么我会叫这个名字，为什么我是我。这样的问题似乎永远也无法回答，有的人终其一生都在寻找这个答案。与此同时，也有很多人不曾问过自己想要怎样的一生，只是被动地随波逐流，浑浑噩噩地走过这一生，如同未曾醒来的查理。而最火十分讽刺的结果是，智慧的查理穷尽毕生之力，证明了天才查理是一个失败的科学实验产品。他必将沿着阿尔吉侬智力衰落离世的生命轨迹，落寞地回到智障的世界。更加讽刺的时候，当他的智力回到正常水平的时候，艾丽斯主动来求和，认为他们现在是平等的，可以继续相爱；智力回到68以下时，面包店老板也重新收容了他，他以前的朋友也想要和他重归于好。
我不知道哪一种状态是快乐的，是愚蠢但很多朋友，或者是聪明但孤身一人。对我来说，也难以做出选择，我们大多数人都处在一个中庸的阶段，就是一个普通人，但对于很多人来说，普通，是他们所奢求的，我们能够平平淡淡的过完这普通的一生，其实就是已经成为了生活中的少数人。
整本书以第一人称日记写成，为了符合查理的人物身份，一开始的进展报告甚至满是错别字，随着手术，我们跟随着查理的日记一起成长，用后来查理自己的话来说就是：“我经常翻阅早期写的进展报告，那些报告错误百出，字里行间充满稚嫩。以现在的眼光看来，当时的我就像弱智者隐身在黑暗的房间内，透过钥匙孔往外面的花花世界窥视，眼睛被闪烁的光线刺得几乎张不开。”透过作者巧妙的安排，整本书我们就像看着查理坐在我们对面跟我们讲述他自己的故事一样亲切。
如果不曾见过太阳的话，他本是可以忍受黑暗的。残酷的是，见过太阳之后返回黑暗的人类。但是如果重来一次，我相信查理高登还是会选择接受手术。
