windows平台进行本地blast

windows平台进行基本三部曲

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  • 建库
    makeblastdb.exe -in unigene.fasta -dbtype prot -out unigene.db
    注意：若建立的是氨基酸数据库，则-dbtype相应的改为nucl

    图片.png

  • 比对
    blastn.exe -query msh.fasta -out blast.out.xls -db unigene.db -evalue 1e-5 -outfmt 6

    outfmt

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