在使用bamCoverage将bam文件转换成bw文件时发现日志文件有许多警告信息:
[W::hts_idx_load3] The index file is older than the data file: /data1/work_rna2/GSE97239/results/mapping/SRR5398215/SRR5398215.rmdup.bam.bai
网上搜索看到有的帖子说就是因为bam文件索引产生的时间比bam文件早,感觉不太可能,肯定是先有bam文件再建的索引,但是结果一看果然如此。可能是因为是远程挂载服务器的原因(在一个服务器上跑的任务,但是输出在另一个服务器上)。
可以忽略这个问题,但是一直会往日志中写入这个报错信息。
可以使用touch命令来更改文件的时间戳来解决。