bamCoverage报错：[W::hts_idx_load3] The index file is older than the data file: ·····.bam.bai

在使用bamCoverage将bam文件转换成bw文件时发现日志文件有许多警告信息：

[W::hts_idx_load3] The index file is older than the data file: /data1/work_rna2/GSE97239/results/mapping/SRR5398215/SRR5398215.rmdup.bam.bai

网上搜索看到有的帖子说就是因为bam文件索引产生的时间比bam文件早，感觉不太可能，肯定是先有bam文件再建的索引，但是结果一看果然如此。可能是因为是远程挂载服务器的原因(在一个服务器上跑的任务，但是输出在另一个服务器上)。

可以忽略这个问题，但是一直会往日志中写入这个报错信息。

可以使用touch命令来更改文件的时间戳来解决。

最后编辑于 ：
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容