BUSCO多样本作图

BUSCO的原理及安装使用可参考:BUSCO - 组装质量评估 - 简书 (jianshu.com)

将每个fasta的busco评估结果移到同一目录下

mkdir summaries 
mv short_summary.sc.1.txt  ./summaries
mv short_summary.sc.2.txt  ./summaries
mv short_summary.sc.3.txt  ./summaries
mv short_summary.sc.4.txt  ./summaries

运行作图程序,但报错提示没有匹配的文件,应该是文件名不符合要求

python scripts/generate_plot.py –wd my_summaries

2022-05-17 10:32:38 WARNING:    No files matching the pattern short_summary.* were found in ./

查脚本发现对short_summary有名字格式要求:
Keep the file named as follow: short_summary.[generic|specific].dataset.label.txt, 'label' being used in the plot as species name

重命名,label部分将会显示在图例

mv short_summary.sc.1.txt  short_summary.sc.dataset.Illumina.txt
mv short_summary.sc.2.txt  short_summary.sc.dataset.Pacbio.txt
......
运行成功
生成的图像
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