一边记录一边加深印象

读取：

windows下，中文路径可能OSErro ，使用engine='python'，sep分隔符

raw_df = pd.read_csv('D://WORK//整理OTU//otutab_norm_tax.xls',engine='python',sep='\t')

读取excel,选择第一列作为index（主要是方便对后面的列进行计算）

pd.read_excel(file,sep='\t',index_col=0)

存储：

直接输出到Excel，to_csv也很常用，当index为数字时，常常去掉，

df.to_excel('/Users/my/Documents/整理//otu.full.xls',index = False)

将多个dataframe输出到同一个excel中，需要确定startrow 与startcol，防止覆盖

write = pd.ExcelWriter(outfile)

 group_prcent_t_df.to_excel(write)

 group_prcent_df.to_excel(write,startrow = 8)

 write.save()

数据框整理：

转置：

prcent_t_df = pd.DataFrame(prcent_df.values.T, index=prcent_df.columns, columns=prcent_df.index)

移动列位置：

OTU_df = p_df.OTU    

p_df = p_full_df.drop('OTU',axis=1)

p_df.insert(0,'OTU',OTU_df)

去除多列：（好像不能超过6列？）

p_df = p_df.drop(['Kingdom','Phylum'],axis=1)

数据框计算：

groupby:

分组，统计，输出

p_df.groupby('OTU').sum().to_excel()

列计算：

group_prcent_df[col] = group_df[col]/group_df.sum()[col]