串联法和并联法构建进化树

串联法和并联法构建进化树

串联法(Concatenation):先将不同物种之间的每个单拷贝基因单独进行多序列比对,然后将这些比对后的单拷贝基因进行首尾相连串接成一个supergene矩阵,最后将这个supergene用于构建系统发育树。

并联法(Coalescence):先将不同物种之间的每个单拷贝基因单独进行多序列比对,并构建每一个单拷贝基因对应的基因树,然后将所有单拷贝基因对应的基因树进行合并重构出相应的物种树,再进行ML系统发育树的构建。

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