前两节已经对分子对接过程中,蛋白和小分子的基本的准备工作进行了介绍。相信大家应该很容易掌握到其中的操作内容,一旦受体和配体分子准备完毕之后,下一步就可以进行分子对接的实战操作了。那么,今天木初给大家介绍的主要是vina分子对接的主要软件的下载和安装过程。
1 Vina是免费的分子对接软件,首先是进入官网下载相关软件(http://vina.scripps.edu/download.html);
2 下载文件之后,对文件进行安装,这个其实就属于一个解压过程,会得到三个文件;
3 另外一个软件是AutoDockTools,也可以在官网直接下载到,直接默认安装,保留AutoDockTools 1.5.6快捷方式;
4 设置默认工作路径,最好放在C盘的新建文件夹下,复制文件夹路径,打开软件File-Preference,粘贴文件夹路径,点击set makedefault,设置完毕;
5 通过命令提示符选定软件所在文件夹,打开vina程序。
6 选定设定的文件夹,输入软件名称,即可运行vina软件,如果涉及环境变量问题,我们将在下一节进行修改环境变量设置;
好了,以上就是关于Vina分子对接中主要的软件的安装步骤,其实非常简单,希望对大家有用。有问题可以关注木初 或者在下方留言,今天就到这里了,谢谢大家。