学生对显微镜的兴趣是非常浓厚，但是实验操作对小学生而言，存在一定的难度。显微镜使用共三课时。第一课时中包含两个内容（装片制作、显微镜使用），试教后考虑可以将临时装片制作放在后一节课，降低第一次接触显微镜的学习难度，确保每个学生能正确使用显微镜，改用永久性的装片进行观察。 草履虫等微生物的准备，由于第一次培养，对于草履虫的培养温度、环境、时间等都没有经验，第一次的培养没能成功，只能调节教学顺序，等待第二轮的培养。材料准备需提前一周确认，避免匆忙被动的情况。
因为所取的水源有限，鼓励学生取家周围不流动的水（池塘、鱼缸），在课上观察，可观察到的微生物种类变多，如果投入更过的时间，可以对不同地方的水进行微生物的调查和分析，让科学的应用性和生活感更强
微生物种类很多，当观察到不认识的微生物时，应及时记录（拍照、画图、描述），发展资料查找的学习方法。
