记录几个命令吧。
1.先安装add-apt-repository命令
sudo apt-get install python-software-properties
sudo apt-get install software-properties-common
2.添加源，然后通过apt-get命令安装swftools
sudo add-apt-repository ppa:guilhem-fr/swftools
sudo apt-get update
sudo apt-get install swftools

Java端调用的话

//执行命令将其转成swf
            String cmd = "/usr/bin/pdf2swf -t "+原始文件+"  -o  "+目标文件 +" -s flashversion=9 -s poly2bitmap ";
            Runtime run = Runtime.getRuntime();//返回与当前 Java 应用程序相关的运行时对象  
            try {  
                Process p = run.exec(cmd);// 启动另一个进程来执行命令
              //取得命令结果的输出流    
                 InputStream fis=p.getInputStream();    
                //用一个读输出流类去读    
                 InputStreamReader isr=new InputStreamReader(fis);    
                //用缓冲器读行    
                 BufferedReader br=new BufferedReader(isr);    
                 String line=null;    
                //直到读完为止    
                while((line=br.readLine())!=null)    
                 {    
                     System.out.println(line);    
                 }    
            } catch (Exception e) {  
                e.printStackTrace();  
            }