subprocess.run(cmd)
cmd里是不能有重定向的大于号>的
如果有这个大于号会被识别为参数
cmd02 = [show_coords,'-THrd','out_m_i90_l100.delta','>','out_m_i90_l100.coords']
print(' '.join(cmd02))
subprocess.run(cmd02)
这个命令运行就一直没有成功
如果需要用大于号重定向
就需要用到check_output()函数
cmd01 = ['bedtools','complement','-i',i_path01,'-g',g_path01]
print(' '.join(cmd01))
with open(o_path01,'w') as fw:
fw.write(subprocess.check_output(cmd01).decode())
subprocess.check_output(cmd01)可以将输出到屏幕的内容保存下来，然后再将其写到文件里
