装包记录

magick包安装

先用conda

conda install -c conda-forge imagemagick

再install

ComplexHeatmap安装

BiocManager::install("ComplexHeatmap")

ggdendro安装

install.packages("ggdendro")

ggh4x安装

devtools::install_github("teunbrand/ggh4x")

scRNAtoolVis安装

devtools::install_github('junjunlab/scRNAtoolVis')

clusterProfiler安装

devtools::install_github('YuLab-SMU/clusterProfiler')
BiocManager::install("org.Hs.eg.db")

报错enrichplot没有安装，找到一个新的命令
还是去安装enrichplot吧

BiocManager::install(“topGO”)
BiocManager::install("enrichplot")

jupyter要用到插件nodejs，尝试用conda安装

conda install -c conda-forge/label/cf202003 nodejs

Pasted Graphic 2.png