《第六日》讲述了在不久的将来，人类科技的技术已发展到可以克隆任何生物，例如复制羊，鱼、甚至包括人类本身。不过克降人类仍然被宣布为非法行为。但充满野心的科学家却不死心的继续秘密地研究复制人类的可能性，而他们其中的一个成功的实验品就是亚当.吉布森。有一天他回到家中，却发现有一个同他一模一样的克隆人已经霸占了他的家。正在亚当惊疑之际、一伙人绑架了他、并把他投进了一个神秘的邪恶世界，因此他必须要在最短的时间内找出他背后的阴谋是什么，夺回属于他的生命和他最爱的家庭，揭发这一阴谋。
那么影片的核心克隆究竟是什么呢?克隆的基本过程是先将含有遗传物质的供体细胞的核移植到去除了细胞核的卵细胞中，利用微电流刺激等使两者融合为一体，然后促使这一新细胞分裂繁殖发育成胚胎，当胚胎发育到一定程度后再被植入动物子宫中使动物怀孕，导致可产下与提供细胞者基因相同的动物。这一过程中如果对供体细胞进行基因改造，那么无性繁殖的动物后代基因就会发生相同的变化。克隆一个生物体意味着创造一个与原先的生物体具有完全一样的遗传信息的新生物体。在现代生物学背景下，这通常包括了体细胞核移植。在体细胞核移植中，卵母细胞，被除去，取而代之的是从被克隆生物体胞中取出的细胞核，通常卵母细胞和它移入的细胞核均应来自同一物种。由于细胞核几乎含有生命的全部遗传信息、宿主卵母细胞将发育成为在遗传上与核供体相同的生物体。线粒体DNA这里虽然没有被移植、但相对来讲线粒体DNA还是很少的，通常可以忽略其对生物体的影响。
