学习笔记(1) 2021-09-28

GSE开头--数据集;GSM开头--数据集里面的一个样本。

GEO2R数据分析:先选择对照组;再选择处理组

DEG默认的最低标准:logFC的绝对值 > 1. 且 矫正P值(adj.P.Val) < 0.05。

logFC具有方向性,如果为负数代表相较于对照组是低表达的,如果为则代表是高表达。

GEO2R只适用于表达谱芯片分析。

药物和靶标信息数据库--SuperTarget(https://bioinformatics.charite.de/supertarget/index.php?site=home

RNA与药物敏感性数据库--RNAactDrug(http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/RNAactDrug/

疾病相关基因检索数据库-Phenolyzer(http://phenolyzer.wglab.org/)

...


(临床工作的知识点的密度很低,但还是需要点滴积累。最近组上有患者病情很重,最夸张的是昨天接了20个左右的护士站电话吧,家属有点放弃了的样子,不知道呢,不知道今晚是不是一个平安夜。困了,晚安呀~)


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