问题一:GO和KEGG富集倍数(Fold Enrichment)如何计算
见链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/264504322
问题二:如何利用EXCEL计算Q值
BH算法的公式为:
Q value = p *(m/k)
其中,m是检验的次数,k是这次检验的p value在所有检验中的排名。
例如,我们对10000个基因进行表达差异分析。那么每个基因都会得到一个p value。现在,我要估算每个基因对应的Q value,就可以用以上公式计算。由于检验次数是10000次,理论上m=10000。然后将所有基因的p value从小到到大排序,确定每个基因对应的k值。
如果一个基因对应的p value在10000个基因中排名第一,那么这个基因对应的k=1。如果一个基因对应的p value在 10000个基因中排名第100,那么这个基因对应的k=100。
第二部分参考:https://www.sohu.com/a/326691378_278730?qq-pf-to=pcqq.c2c