2022-06-17 单细胞数据转换

  • Seurat 格式转换成SingleCellExperiment
    library(sceasy)
    sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="sce", outFile='filename.rds')
  • Seurat 转换成 AnnData
    sceasy::convertFormat(seurat_object, from="seurat", to="anndata", outFile='filename.h5ad')
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