解决Linux Rstudio server 安装AnnoProbe报错

本次配置的环境是Linux版本的R studio server。
直接install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")安装出现installation of package ‘AnnoProbe’ had non-zero exit status。
可以先尝试安装一些依赖的包,以下是根据提示需要安装的包（不一定全）。
'''
if (!requireNamespace(c('nloptr','lme4','ggpubr','pbkrtest','car','GEOquery', 'ggpubr'), quietly = TRUE)){
BiocManager::install(c('nloptr','lme4','ggpubr','pbkrtest','car','GEOquery', 'ggpubr'),dependencies = T)}

library(remotes)
install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")
'''
在安装过程中出现依赖的包不存在导致安装失败，

图片4.png

查看报错的上方是否有以下的提示，如果出现，则需要使用Linux root权限按照提示安装cmake，安装完成后从再次安装即可。

图片1.png