R报错ensembldb::filter requires an ‘EnsDb‘ object as input. 解决办法及MethylCIBERSORT包运行

在我使用MethylCIBERSORT这个R包的时候,运行下面这个代码


出现了下面这样的报错:


然后我就复制报错内容,尝试找到解决办法,但网上没有针对这个报错的方法,我去了谷歌,遇到一个类似的问题:

提问者提出ensempldb与dplyr之间有几个功能冲突,问能否有好的解决办法。

回答如下:


意思就是加个前缀,里面很详细了。


但这种方法并不适用我的这种问题,FeatureSelect.V4函数是内含了filter,没办法加前缀。


然后我想到出现这个问题的本质还是包之间冲突了,我就尝试卸载dplyr包(好像不要轻易尝试),然后重新加载。

接着运行FeatureSelect.V4函数,然后就成了!

(截图没截完)

花了很长时间,终于解决,还是经验不足,有做甲基化反卷积的小伙伴可以一起交流!科研不易,遇到可爱的人会让我更可爱哈哈。

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