最近这几天在学习用R语言完成主成分分析,印象里在公众号分享的文章里看到过可视化主成分分析结果的包,通过微信的搜索功能找到了公众号 宏基因组 分享的文章 ggbioplot-最好看的PCA作图。简单记录一下自己的重复过程,通过help()函数查看帮助文档help(package="ggbiplot")可以看到这个包共有两个函数ggbiplot()和ggscreeplot()和一个数据集wine
帮助文档中的例子代码
帮助文档代码运行结果图
用biplot()函数绘制的结果图
第二幅图相对于第三幅确实美化很多,而且ggbiplot()函数还有和多参数,应该可以调整一下细节是结果更加美化
ggord包可以添加置信区间,通过install_github()包安装install_github("fawda123/ggord")
就简单记录到这里吧,明天仔细研究一下主成分分析的过程及意义