AnnData.obs
store the metadata of cells (barcodes)
Data type:
>>> type(scanpy_object_used.obs) anndata._core.views.DataFrameView
Note:
.obs
的格式是DataFrameView
而不是DataFrame
,采用以下方式进行 转换kk=pd.DataFrame(scanpy_object_used.obs) '# 将 DataFrameView 转换为 DataFrame type(kk) kk.iloc[:3, :3] #查看 前3行 和 前3列 的信息
Shape:
>>> scanpy_object_used.obs.shape '#查看 shape 属性 (2643, 5)
View the data:
scanpy_object_used.obs.head(5) '# 查看此数据的前 5 行
Re-name (rename) one column :
scanpy_object.obs.rename(columns={'previous': 'new_name'}, inplace=True)