电影版起源
《银河护卫队1》（2014）第57分29秒最早，《复仇者联盟3》（2018）第13分25秒更形象地揭秘了无限宝石的由来。
宇宙诞生之前，六大奇点就存在了，大爆炸后，新生宇宙里，奇点的碎片被熔铸成六颗结晶体原石（Gem） ，也就是无限宝石（Stone）。从57分35秒的壁画中，能看到无限宝石熔铸阶段是由宇宙四大神明收集完成的，分别是永恒（Eternity）、死亡（Death）、无限（Infinity）、熵（Entropy）四大神明。
漫画版起源
很久很久以前，这六颗宝石（起初是作为Soul Gems出现的，开始改叫Infinity Gems，最后电影中才确认叫Infinity Stones，可以认为无限原石与无限宝石只是叫法不同，没有任何实质区别）是一个叫做复仇女神（Nemesis）的远古实体的重要组成部分，她没有继续作为宇宙中唯一有意识的神明而存在而是选择毁灭了自己，从毁灭中产生了六颗无限原石——宇宙的六个关键组成部分：心灵、现实、力量、空间、时间和灵魂。
复仇女神/全能女神
Nemesis，译作复仇女神，或称全能女神，这位宇宙实体的起源尚不清楚，可以认为曾经是有意识的人形状态的无限宝石。在它进化到某个阶段，她厌倦了自身的存在，自愿粉碎成六颗被认为是无限宝石的结晶体。每颗宝石都有一份特殊的天赋，最终会传递给宝石持有者。宇宙级的吸血鬼Rune策动了一系列事件让这个无比强大的实体存在再次组合，Rune进入了漫威宇宙，打败了无限宝石守望者组织（Infinity Watch），还曾与银影侠斗争；银影侠效命于生命法庭，将无限宝石归还漫威宇宙来保护现实世界。银影侠最终打断了Rune一只手，拿到了六颗无限宝石中的5颗。因为Rune将亚当术士的灵魂宝石贴在了自己额头上。
这五颗宝石散落在了超光速宇宙（Ultraverse）中，Lord Oumpkin获得了力量宝石，给予了他难以置信的力量和能量；Hardcase拥有了时间宝石，他甚至通过创造一条新时间线来保全他的手下，不让他们在战斗中牺牲。
而神域雷神的同父异母弟弟洛基不知怎么进入了这个超光速宇宙，集齐了全部六颗无限宝石。宇宙级长老高天尊（Grandmaster）找到了他，试图骗走无限宝石。高天尊用还存在未知的第七颗无限宝石，被称为“自我宝石”（Ego Germ）与洛基打赌对战。
高天尊将复仇者联盟选为他的冠军团队，而洛基选择了超力战队（Ultraforce）作为他的棋子，最终通过使用现实宝石赢下了赌注，并获得了与永恒族瑟西（Sersi，权游瑟曦是Cersi）有关的这第七颗无限原石——自我宝石。当瑟西见到洛基，二人结盟，合力将所有“非常6+1”颗的无限宝石重新组合，并复活了复仇女神涅墨西斯（Nemesis）。
北境钢铁侠
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