如何使用SPDE进行基因家族分析---热图、共表达调控网络、韦恩图、GO 富集分析图

如题所示的这几种图没什么好说的，本文集前面已经有了足够的介绍，在这里就向大家再强调一下输入文件的格式吧：

热图：


这就是一个计算基因表达量最常见的一个，什么处理，什么基因表达是多少，整理这样一个文件之后就可以交给SPDE了。

共表达调控网络。文件一共就只有两列。第一列是HUB基因；第二列是edge基因。


韦恩图。就是一列，大家将想要展示的东西放在不同的文件中，然后依次拖入文件框就好：


GO富集分析图。这个需要借助REVIGO网站做就好，前面已经提到不再赘述。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明：文章内容（如有图片或视频亦包括在内）由作者上传并发布，文章内容仅代表作者本人观点，简书系信息发布平台，仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容