一、来源不同
1、原生app：原生app是与移动设备所安装的操作系统所使用的同一种编程语言开发的APP。
2、web app：web app是由html5所做的网站通过一些打包平台或者使用工具打包而成的软件。
二、开发成本不同
1、原生app：原生app开发成本高，需要使用单独的开发工具进行开发。
2、web app：web app开发成本低，不需要使用单独的开发工具进行开发。
费用方面。原生应用的开发成本是大于web应用的成本。安卓官方给定的安卓开发语言是java，而web应用的开发没有语言限制，你可以是java，python，php，asp，aspx等等主流的文语言都可以。而相对于原生应用web应用所需要的费用会大大降低，而许多webapp基本上就是一个网站打包成应用的模式。所以费用相对来说低。
性能方面。原生应用所有的资源已基本上写在了应用里面，所以打开速度相对于从服务器端还要再次加载资源的web应用来说会快很多。原生应用完美的支持了手机的底层功能。而web应用打开速度还要根据当前网络环境、服务器环境等因素所影响，这性能方面输给了原生应用。
稳定性
目前市场的web版的APP多为模板，这种模板价格便宜，但是功能无法拓展，而且随着市场上浏览器、技术的进步，会逐步出现各种问题，稳定性根本无法保证。
