diamond2: 蛋白序列比对软件

本文主要讲述diamond软件的升级版diamond2，该文章于2021年4月7日发表在nature methods上

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diamond2主要以blastp为标准。从下图可以看diamond2在速度上快diamond 6-8倍，快blastp 8000倍以上。在低错误率下，非常敏感和超敏感模式下的diamond2保持与BLAST相同或略好的灵敏度。

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因此diamond2的更新还是很有必要的，尤其是对于那些宏组学数据量以TB来计算的科研工作者门。

安装步骤如下：

wget http://github.com/bbuchfink/diamond/archive/v2.0.13.tar.gz
tar xzf v2.0.13.tar.gz
cd diamond-2.0.13
mkdir bin
cd bin
cmake ..
make -j4
sudo make install